中科大停止知网查重主要是因为知网查重系统的准确性和完整性受到了质疑。学术界对知网查重系统的误差率提出了质疑，认为其无法完全准确检测出所有抄袭行为。此外，知网查重系统的覆盖范围也存在局限性，无法涵盖所有的学术资源，导致查重结果不够全面。

另外，中科大停止使用知网查重系统也是为了推动学术界对抄袭问题的更深入思考和探讨。停止使用知网查重系统可以促使学者们更加注重学术诚信和原创性，避免过分依赖查重工具。这也提醒了学术界需要更多关注如何培养学术道德和独立思考能力，而不是简单地依赖技术手段来解决问题。